EGassembler はショットガンシーケンスや EST 断片をアッセンブルソフトウェア (web) です．Help > EGassembler Tutorial にチュートリアルがあります．

• .zip ファイルでアウトプットファイルがダンロードできます．XXXX.cap34.ZIP にファスタ形式で，Contig 1, Contig 2, と名前がつけられたファイル (XXXX.contig) が保存されています．XXXX.singleton はつながらなかった配列です．XXXX.out につなげた配列の情報が書かれています．
  
  
• アッセンブルソフトが誤りを起こす場合もあります．このため，例えばある種において一つの遺伝子を見つけるのであれば，EST 配列を NCBI などから fasta 形式でダウンロードし，クエリ配列をもちいてこのファイルを local blast で検索する方が安全な場合もあるそうです．