TreeView X は系統樹を表示するプログラムです．画面をそのまま Illustrator などにコピー & ペーストできるので，私は Ver. 0.4.1 が好きです．旧バージョンはこちらからダウンロードできます．

Mac OSX Lion では v. 0.5.0 がインストールできませんでした．こちらに従ってインストールできるかもしれませんが，私は失敗しました．Lion や Mountain Lion では FigTree を使っています．

Newick 形式のテキストをそのまま TreeView にコピー & ペーストすれば，系統樹が図示されます．もちろん，画面のテキスト形式にある最初の行「69 1」を取り除いて保存し，TreeView にドラッグ & ドロップすることでも，系統樹を図示することができます．