機能推定されている遺伝子の割合
10 June. 2019. Jun Inoue
Human

Human

Human Protein Atlas

ヒトの遺伝子モデルのうち,実際にタンパク質の存在が確認できたものを表示.

Shalem O, Sanjana NE, Hartenian E, Shi X, Scott DA, Mikkelson T, Heckl D, Ebert BL, Root DE, Doench JG, et al. 2014.
Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells. Science 343:84-87.

遺伝子の機能破壊という観点で,CRISPR-Cas9 でヒト培養細胞に対して,ゲノムワイドに >18,000 遺伝子をノックアウトして報告.

The Gene Ontology C. 2019. The Gene Ontology
Resource: 20 years and still GOing strong. Nucleic Acids Research 47:D330-D338.

直接の遺伝子数ではないが,gene ontology の functional evidence records 数を示す.
GO の evidence codes についてはこちらの資料を参照.


ショウジョウバエ

Mitsakakis N, Razak Z, Escobar M, Westwood JT. 2013. Prediction of Drosophila melanogaster gene function using Support Vector Machines. BioData Min 6:8.

14,029 遺伝子のうち,28% が Gene Ontology (GO) term がない (curated と electronic アノテーションを含む).58% だけが GO-BP (BIological Process) を持つ.Electronic accnotation を除くと,41% だけが GO-BP term を持つ (P1 下).


謝辞
OIST の元同僚 AA さんに教えていただいた情報を掲載しています.