Popart |
Popart はハプロタイプネットワークを作成するソフトウェアです．描画を行い，画面上で図の操作ができます．
Fst は全体値しか算出できないので，集団間など細かい解析を行う場合は，Arlequin などを使う必要があります (MY さんより)．
| 例題 1 |
Y12.nex.tar.gz
Yorifugi et al. (2012). ギャップはカウントされないので，それぞれのサイトで，ギャップを他に使われてない配列 (大文字) に変換しています．
| 例題 2 |
sogabeTakagi13.nex.tar.gz
Sogabe and Takagi (2013): Lineage A, Cyt b 解析 (Fig. 2a, AddFile 1)．
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