214 Actinopterygii data set から COX1 gene を抽出

Editor で Actinopterigii.strings を開ける．

Danio rerio NC002333 を選ぶ

Sequence を Double click

Show を All features in .... に変更する．

CDS の COX1 を選択する．

close.

ズームすると COX1 の領域が >>>>> となっている．

Functions → Database Sequence Searching → FastA → Selected region

FastA of に Danio の COX1 の番号が書いてある．

Search set で genebank を remove

Add sequence file で， Filter を /home/inoue/Act* とする

Filter を押す．

Actinopterygii.strings を選ぶ

Add → Cancel

Add Database Sequence... から Viral を選ぶ (Viral からランダムに得られる配列をバックグラウンドとして，Similarity を計算するらしい)

Add to Search Set

Close

Number of processors to use を 4 にする

options で Show sequence alignments in output file を選ぶ (これはうまくいかなければ，外してもう一度挑戦するらしい)

close

List socres unit reaches (たまに変更する．10 では出ないらしい．0.001 ぐらいだろうか)

Run