SMART_batch.zip

ステップ	目的
SMART_batch.pl	大量配列を自動で Yes / No 判定
テキスト解析（py/grep）	GH9 候補の抽出・整理
Web SMART	人間向けの視覚的確認・図作成

Excel で Glyco_hydro_9 が入っているセルをハイライト

Pfam ドメイン

GT2

NCBI CDBB (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi) で「Cellulose_synt」を検索すると以下のページが出ます。

Cellulose_synt

Glyco_trans_、が GT2 である、と説明しているWebサイト: GenomeNet

#=GF DE Glycosyltransferase like family 2
#=GF DR CAZY; GT2;

DE（Description）: Glycosyltransferase like family 2
DR（Database Reference）: CAZy; GT2
Glyco_tranf_2_3 は CAZy の GT2 に属する

InterPro：Glycosyl transferase family 2（GT2 の定義）
(https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF00535/)

このページの Member databases / Included Pfam entries には：

Pfam: Glycos_transf_2
Pfam: Glyco_trans_2
Pfam: Glyco_trans_2_3
Pfam: Glyco_tranf_21

などの Glyco_trans_ 系 Pfam ドメインが含まれます*
（InterPro 内部で GT2 クランに統合）。

*ここが「Glyco_trans_ 系 Pfam ＝ GT2 系」という分類の根拠**です。

GH8

SMART（および元になっている Pfam）の
Glyco_hydro_8 ドメインは、CAZy 分類でいう GH8（Glycoside Hydrolase family 8） に対応します。

対応関係の整理

SMART / Pfam 名：Glyco_hydro_8
CAZy ファミリー名：GH8
意味：グリコシド加水分解酵素ファミリー8

SMART や Pfam では、CAZy の GH ファミリーに対応するドメインが
Glyco_hydro_◯ という名前で定義されていることが多く、

Glyco_hydro_8 = GH8