/* Which Model to use? */
modelinf.Gene1
[用いる遺伝子 (パーティション) を変更する場合は，上の行を新たな modelinf ファイルの名前に変更します]
L /* How much output? Options: L = Loud mode (prints more output, the
default), Q = Quiet mode (prints less output - use with parametric
bootstrap) */
D /* Predict Secondary Structure? Options: P= predict, D = do not predict
(the default option) */
N /* Does user tree specify names (N) or specify order (O) of sequences
in sequence data file? */
/* The topology is in the file listed below*/
example.tree
[用いる樹形を変更する場合は，上の行を新たな tree ファイルの名前に変更します]
/* End of hmmcntrl.dat */