GARLI は Heuristic search を用いて最尤法・GTR+I+G モデルに基づいて系統樹を探索するプログラムです．Hillis 研の大学院生であった Zwickl さんが作成しました．

　売りは，OTU が多くても MrBayes より速く結果が得られる点にあると思います．2006 年になってから私の周りで話しに出るようになり，6 月に行われたSoltis lab の研究発表会でも，200 OTU 以上にわたる大系統の解析に用いていました．どのような計算方法なのか，いまいろいろ調べています．

　Graphical Mac OSX version を使ってみたのですが，使い勝手は良さそうです．Generation を経るごとに尤度が改善されてゆくプロットが表れ，さらに計算途中でその時点での最尤樹を見ることができます．

　infile は Nexus か Phylip 形式です．Nexus 形式ですが，MacClade を用いて Nexus 形式で保存してもうまく読み込みませんでした．ブロックではなく Sequence の部分に問題があるようです．Phylip 形式に保存した Sequence に，Nexus のブロックを貼り付けたらうまく動きました．

　Mac G5 2.5x4 でパラレル解析に成功したという話を聞きました (2006 年 11 月 30 日)．